9-12 Nisan 2011 İstanbul Üniversitesi

SONUÇ:  Elk-1  transkripsiyon  faktörünün  nöronların  farklılaşmasında  indükleyici  bir  rolü  olduğu  ve  tümör 
hücrelerinde  birçok  bölgeden  fosforlandığı  gözlemlenmiştir.  Elk-1  ,  motor  proteinler,    sentomer    bağlantılı 
proteinler  gibi  mitoz  ilişkili  proteinlerin  incelenmesi,  glioblastoma  ve  nöroblastoma  gibi  agresif  tümör 
hücrelerinde kanser tedavisinin başarısını arttırılabilir.  
 
Anahtar Kelimeler: Elk-1, Motor proteinler,  Beyin tömürleri, Mitoz
 
 
Investigation of the interaction between Elk-1- and mitotic proteins 
 
OBJECTIVES:  Elk-1  is  a  member  of  the  ETS  domain  superfamily  of  transcription  factors,  and  has  been 
traditionally  associated  with  mitogen-induced  immediate  early  gene  transcription  upon  phosphorylation  by 
MAPK.    It  is  known  to  be  upregulated  as well  as  to respond  to  ERK/MAPK  and  PI3K  activation  in  brain  tumor 
cells.  Also  P-S383-Elk-1  is  associated  with  mitotic  spindle  poles  from  metaphase  through  telophase,  and 
relocates  to  the  spindle  midbody  during  cytokinesis.    In  this  study,  we  aimed  to  explore  the  interactions 
between Elk-1 and mitotic proteins, including motor proteins and CENP-E. 
MATERIALS  &  METHODS:  The  interaction  between  Elk-1  and  mitosis-related  proteins  in  glioblastoma  and 
neuroblastoma cell lines will be analyzed by immunoprecipitation and Western blotting. 
RESULTS:  Elk-1 was found to be present in mitotic spindles, particularly at the spindle poles, early in mitosis 
and relocalized to the spindle midbody just at cytokinesis.  Therefore in this study we have tried to pinpoint the 
interaction  of  Elk-1 with  mitotic  motor  proteins,  as well  as  chromosomal  passenger complex protein,  CENP-E. 
Although  the  exact  mechanism  and  functional  significance  is  yet  unclear,  these  findings  reveal  a  potentially 
non-transcriptional role for Elk-1 in mitosing cells. 
CONCLUSION:  Elk-1  has  been  implied  as  a  pro-survival factor,  act  as  an  inducer  of  neuronal  differentiation, 
and shown to be phosphorylated in brain tumors by various groups. By targeting the proteins that are involved 
in  mitosis,  such  as  multi  functional  protein  Elk-1,  motor  proteins  and  centromere  associated  proteins,  may 
increase the success rate of cancer therapies in agressive cancer types like glioblastoma and neuroblastoma. 
 
Keywords: Elk-1,  Brain tumors, Motor proteins, Mitosis 

Poster Bildiriler / Poster Presentations 
118 
 
P25 
 
RSK2 mutantlarının c-fos promoter bölgesi üzerindeki etkisi ve RSK tarafından 
fosforlanan RanBP3’ün Elk1’in nükleer translokasyonuna etkisi 
 
Perihan Ünver, Özlem Demir*, Işıl Aksan-Kurnaz 
 
Yeditepe Üniversitesi, Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü, İstanbul 
*Şimdiki adresi: Max Planck Enstitüsü, Dresden, Almanya 
 
Yeditepe University, Faculty of Engineering and Architecture, Department of Genetics and Bioengineering, Istanbul, Turkey 
*Current Address: Max Planck Institute, Dresden, Germany 
 
AMAÇ:  Ras-ERK/MAPK  sinyalizasyon  zincirinin  bir  downstream  efektörü  olan  RSK2  ve  onun  delesyon 
mutantlarının  Elk-1  transkripsiyon  faktörü  tarafından  regüle  edilen  c-fos  promoter  bölgesi  üzerindeki  etkileri  
HEK293  ve  SH-SY5Y  hücrelerinde  gözlemlenmiştir.  Ek  olarak,  RSK  ile  etkileşimi  olduğu  bilinen  Elk-1 
molekülünün  nükleer  translokasyonunun  RSK  tarafından  fosforlanan  RanBP3  molekülünden  etkilenip 
etkilenmediğinin araştırılması amacıyla RanBP3 için mRNA ve siRNA klonlamaları gerçekleştirilmektedir. 
GEREÇ ve YÖNTEM: HEK293 ve SH-SY5Y hücreleri RSK2’nin 13-14, 11-16, 13-15, KA, YA ve KA/YA delesyon 
mutantları ve c-fos promoter bölgesi ile transfekte edilmiştir. Mutasyonların c-fos regülasyonuna etkisi lüsiferaz 
analizleri  ile  gözlemlenmiştir.  Öte  yandan, RanBP3’ün  mRNA  sekansı  ve  gene  knockdown  için  uygun  primerler 
dizayn edilmiş ve klonlamalar yapılmıştır. 
BULGULAR:  RSK2’nin  YA  mutasyonu  c-fos  regülasyonunu  arttırırken,  KA  ve  KA/YA  mutasyonları  Elk-1 
aktivasyonunu  hem  HEK293  hem  de  SH-SY5Y  hücre  tipinde  baskıladı.  13-14  delesyon  mutasyonu  c-fos 
regülasyonunda  artışa  sebep  olurken,  11-16  ve  13-15  mutasyonları  HEK293  hücre  tipinde  regülasyonu 
azaltmıştır.  Öte  yandan,  benzer  şekilde,  11-16  ve  13-15  delesyonları  Elk-1  aktivitesini  SH-SY5Y  hücrelerinde 
baskılamıştır.  Ancak,  HEK293  hücrelerinin  aksine,  c-fos  regülasyonu  13-14  mutant  geni  tarafından  SH-SY5Y 
hücre tipinde önemli ölçüde baskılanmıştır. Bunlara ek olarak, RanBP3’ün Elk-1’in nükleer translokasyonundaki 
etkisini görebilmek amacıyla RanBP3 gen bölgesi için mRNA ve siRNA klonlamaları gerçekleştirilmiştir. 
SONUÇ:  Sonuçlar  göstermiştir  ki;  RSK2’nin  N  terminal  domeni  ve  C  terminal  domeni  ile  bu  iki  domen 
arasındaki  linker  bölgesi  farklı  hücre  tiplerinde  Elk-1  tarafından  regüle  edilen  c-fos  promoter  üzerinde  farklı 
etkiler  göstermektedir.  Öte  yandan;  klonlamaları  gerçekleştirilmiş  olan  RanBP3’ün  Elk-1’in  nükleer 
translokasyonu üzerindeki etkilerinin gözlemlenmesi de mümkün olabilecektir. 
 
Anahtar Kelimeler: Elk-1, RSK, RanBP3, Nükleer translokasyon 
 
Effect of RSK2 mutants on c-fos promoter and effect of RSK-phosphorylated 
RanBP3 on nuclear translocation of Elk-1 
 
OBJECTIVES:  The  effects  of  RSK2,  which  is  a  downstream  effector  of  the  Ras-ERK/MAPK  signaling  cascade, 
and its deletion mutants on c-fos promoter which is regulated by Elk-1 transcription factor were researched in 
HEK293 and SH-SY5Y cell lines. In addition, for the investigation of whether the nuclear translocation of Elk-1, 
which  shows  an  interaction  with  RSK,  is  affected  by  RanBP3,  mRNA  and  siRNA  clonings  were  tried  to  be 
completed. 
MATERIALS & METHODS: HEK293 and SH-SY5Y cells were transfected with the deletion mutants of RSK2 and 
c-fos promoter. Effects of the mutations on c-fos regulation were observed by luciferase assays. On the other 
hand, primers for the mRNA sequence and gene knockdown primers were designed and clonings were done.  
RESULTS: The KA and KA/YA mutations of RSK2 repressed the Elk-1 activation, while the YA mutation induced 
the c-fos regulation in both HEK293 and SH-SY5Y cells. Luciferase reporter assays gave different results for the 
11-16,  13-14  and  13-15  deletion  mutants  of  RSK2  in  these  two  cell  lines.  The  11-16  and  13-15  deletions 
caused downregulation of c-fos, while the 13-14 mutation of RSK2 upregulates it in HEK293 cells. On the other 
hand, similarly, the 11-16 and 13-15 deletions repressed the Elk-1 activity in SH-SY5Y cells. However, unlike 
HEK293 cells, c-fos regulation was significantly repressed by 13-14 mutant gene in SH-SY5Y cells. In addition 
to  these results,  to  observe how RanBP3  affects  the  nuclear  translocation of  Elk-1,  mRNA  and  siRNA  clonings 
were done for RanBP3. 
CONCLUSION:  Results  showed  the  different  effects  of  the  N  terminal  domain  and  the  C  terminal  domain  of 
RSK2 and the linker region between these two domains on the Elk-1 regulated c-fos promoter in different cell 
lines.  On  the  other  hand,  RanBP3  clonings  make  it  possible  to  observe  the  effects  of  RanBP3  on  the  nuclear 
translocation of Elk-1. 
 
Keywords: Elk-1, RSK, RanBP3, Nuclear translocation 

Poster Bildiriler / Poster Presentations 
119 
 
P26 
 
Cu/Zn superoksid dismutaz geninin Elk-1 ile transkripsiyonel aktivasyonu 
 
Göksu Alpay, Işıl Aksan-Kurnaz 
 
Yeditepe Üniversitesi, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü, İstanbul 
 
University of Yeditepe, Department of Genetics and Bioengineering, Istanbul, Turkey 
 
AMAÇ: Cu/Zn superoksid dismutaz proteini reaktif oksijenlerin hücre içindeki konsantrasyonlarını kontrol eder 
ve  superoksid  radikallerinin  katalize  olmalarında  rol  oynar.  Elk-1  ise  ETS  transkripsiyon  faktörlerinden  bir 
tanesidir ve MAPK yolağı ile aktive edilmektedir. Yakın zamanda yapılan araştırmalarda SOD1 geninin promoter 
bölgesinde  pozitif  ve  negatif  regulasyon  bölgeleri  bulunmuş  ve  Elk-1  transkripsiyon  faktörünün  pozitif 
regulasyon  bölgesine  bağlanarak  SOD1  in  aktivasyonunda  rol  oynadığı  görülmüştür.  Bu  çalışmada  Elk-1  in 
SOD1 üzerindeki etkisi araştırılmıştır. 
GEREÇ  ve  YÖNTEM:  Şimdiye  kadar  yaptığımız  çalışmalarda,  insan  SOD1  ve  sıçan  SOD1  geninin  promoter 
bölgesindeki  ETS  motifleri  saptanmış  ve  bu  bölgeler  pgl-3  vektörne  klonlanmıştır.  Pgl-3  lusiferaz  bölgesi 
bulundurmakta  ve  lusiferaz  aktivetisini  ölçmek  için  kullanılmaktadır.  Klonlama  işleminin  ardından  Lusiferaz 
aktivitesi  ölçülerek  Elk-1  in  SOD1  üzerindeki  etkisi  ölçülecektir.  Ayrıca  mutant  Elk-1  geni  taşıyan  plasmidler 
kullanılarak Elk-1 in SOD1 üzerindeki fonksiyonel rolü görülecektir. 
BULGULAR: Sıçan ve İnsan promoter bölgeleri başarılı bir şekilde pgl-3 vektörüne klonlanmıştır. 
SONUÇ:  Şimdiye  kadar  yapılan  çalışmalarda  Elk-1  transkripsiyon  faktörünün  SOD1  promoter  bölgesinde 
bağlanma  motifi  olduğu  gösterilmiştir.  Bu  çalışmada,  Elk-1  geni  mutasyona  uğradığında  ya  da  ortamda 
bulunmadığı zaman SOD1 geninin aktivasyonun düşmesini beklemekteyiz. 
 
Anahtar Kelimeler: SOD1,  Elk-1, Lusiferaz deneyi 
 
Transcriptional activation of the copper/zinc superoxide dismutase 
gene by Elk-1 
 
OBJECTIVES:  Copper/zinc  superoxide  dismutase  (SOD1)  participates  in  the  control  of  reactive  oxygen 
intermediate intracellular concentration and catalyzes the dismutation of superoxide radicals. Elk-1 is a member 
of ETS- domain transcription factor and activated by MAPK pathway.  In recent studies, it has been shown that, 
Elk-1 function as an enhancer in SOD1 transcription. In this study, we aimed to explore the relationship of Elk-1 
with SOD1. 
MATERIALS & METHODS: In present study, we determined the Ets motifs in SOD1 human and rat promoter 
regions and cloned these promoter regions to pgl-3 which is a luciferase vector. We will make Luciferase Assay 
to analyze the effect of Elk-1. We will also use mutated Elk-1 expression plasmids to analyze the functional role 
of the Elk-1. 
RESULTS: Rat and Human promoter regions are succesfully cloned to pgl-3 vector. 
CONCLUSION:  Recently,  it  has  been  shown  that  Elk-1  transcription  factor  has  a  binding  site  on  positive 
regulatory  element  of  SOD1.  We  expected  to  see  a  decrease  in  activation  of  SOD1  when  Elk-1  is  absent  or 
mutated. 
 
Keywords: SOD1, Elk-1, Luciferase assay
 

Poster Bildiriler / Poster Presentations 
120 
 
P27 
 
Türkiye’de Amiyotrofik Lateral Skleroz: Ailesel ve sporadik ALS’de yüksek-
ölçekli genomik yöntemlerin uygulanması 
 
Aslıhan Özoğuz
1
, Kaya Bilguvar
2
, Murat Günel
2
, A. Nazlı Başak
1
 
 
1
Boğaziçi Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Nörodejenerasyon Araştırma Laboratuarı, İstanbul 
2
Yale Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Nöroşirurji Anabilim Dalı, Gunel Laboratuvarı, New Haven, USA 
 
1
Boğaziçi University, Dept of Molecular Biology and Genetics, Neurodegeneration Research Laboratory, Istanbul, Turkey 
2
Yale University, Medical School, Dept of Neurosurgery, Gunel Laboratory, New Haven, USA 
 
AMAÇ:  Amiyotrofik  Lateral  Skleroz  (ALS),  korteks,  beyin  sapı  ve  omurilikteki  motor  nöronların  ölümü  ile 
karakterize olan,  geç başlangıçlı  nörodejeneratif bir  hastalıktır.  ALS’deki  olguların  %90’ı  sporadik  iken  (SALS), 
%10’unda  aile  öyküsü  gözlenir  (FALS).  Bu  çalışmada,  Türk  ALS  olgularında,  daha  önce  tanımlanmış  genlerde 
mutasyonların 
taranması 
ve 
FALS’da 
yeni 
genlerin 
tanımlanmasını 
hedeflenmektedir. 
GEREÇ ve YÖNTEM: 198 Türk ALS olgusu SOD1 genindeki mutasyonlar için araştırıldı. Resesif olarak kalıtılan 
bir  homozigot  D90A  olgusu,  21  İskandinav  ALS  olgusu  kullanılarak  haplotip  analizi  ile  incelendi.  Daha  sonra, 
otozomal dominant ve akraba ilişkisi olmayan FALS ve jüvenil olgular, TDP-43, FUS and ANG genleri açısından 
incelendi. Ayrıca, çalışılan genlerde mutasyon bulunmayan 15 FALS ve 13 jüvenil olgu, tüm genom genotipleme 
analizi  ile  değerlendirildi.  Resesif  bir  aile,  homozigotluk  haritalaması  için  seçildi.  Bu  ailenin  bir  bireyinde, 
homozigot  bölgeler  içerisinde  yer  alan  beş  aday  gen  incelendi.  Aynı  birey,  ‘whole  exome  resequencing’  ile  de 
değerlendirildi.  
BULGULAR:  Altı  FALS  olgusunun,  hastalığa  neden  olan  SOD1  mutasyonu  taşıdığı  gösterilirken,  yedi  tanesi 
seyrek  gözlenen  bir  polimorfizmin  taşıyıcısıydı.  İndeks  olgunun  haplotipinin,  iyi  korunmuş  İskandinav 
haplotipiyle  aynı  olması,  ortak  atadan  geldiklerini  ima  etmektedir.  Beş  aday  gende  mutasyon 
tanımlanamamıştır.  ‘Whole  exome  resequencing’  ile  tespit  edilen  varyasyonlar,  doğrulamak  amacıyla  ileri 
araştırmalarla incelenmelidir. 
SONUÇ:  Bu  çalışma  ALS’nin  moleküler  patogenezi  üzerine  Türkiye’de  bugüne  kadar  yapılmış  en  kapsamlı 
çalışmadır.  Kullanılan  yüksek-ölçekli  genomik  yöntemlerin  ve  sunulan  bulguların  ALS’nin  kompleks 
patogenezinin anlaşılmasına ışık tutacağı umulmaktadır. 
 
Anahtar Kelimeler: Amiyotrofik Lateral Skleroz, Nörodejenerasyon, Genotipleme, Whole exome resequencing 
 
Amyotrophic Lateral Sclerosis in Turkey: Studies on familial and sporadic ALS 
using high-throughput genomic technologies 
 
OBJECTIVES: Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is an adult onset neurodegenerative disorder, characterized 
by the death of motor neurons in the cortex, brainstem and spinal cord. Most incidences are sporadic (SALS), 
while  10%  have  a  family  history  (FALS).  This  study  aims  to  search  for  mutations  in  the  previously  defined 
genes in the Turkish ALS cases and to identify new genes in FALS.  
MATERIALS  &  METHODS:  198  Turkish  ALS  cases  were  investigated  for  mutations  in  the  SOD1  gene.  One 
homozygous  D90A  case,  represented  as  recessive,  was  investigated  by  haplotype  analysis,  using  21 
Scandinavian ALS cases. Next, otosomal dominant nonconsanguineous FALS and juvenile cases were analyzed 
for  the  TDP-43,  FUS  and  ANG  genes.  Additionally,  15  FALS  and  13  juvenile  cases,  negative  for  the  tested 
genes,  were  analyzed  by  whole  genome  genotyping.  A  recessive  family  was  preselected  for  homozygosity 
analysis.  Five  candidate  genes  were  examined  in  one  of  the  family  members.  The  same  individual  was  also 
assessed by whole exome resequencing.  
RESULTS:  Six  cases  were  shown  to  carry  disease-causing  SOD1  mutations,  while  six  were  carriers  of  a  rare 
polymorphism.  The  haplotype  of  the  index  case  was  identical  to  the  conserved  Scandinavian  haplotype, 
implying  a  common  ancestry.    No  mutation  was  identified  in  five  candidate  genes.  The  specific  variations 
detected via whole exome resequencing will be subjected to further analysis for confirmation.  
CONCLUSION: This is the most comprehensive study performed in Turkey on the molecular genetics of ALS. 
The high-throughput methodologies used and the findings presented in this study are expected to shed light to 
the complex pathogenesis of ALS. 
 
Keywords: Amyotrophic Lateral Sclerosis, Neurodegeneration, Genotyping, Whole-exome resequencing 

Poster Bildiriler / Poster Presentations 
121 
 
P28 
 
Alsin'in etkileştiği olası genler ve Alsin ifadesinin bu genlere olan etkisi 
 
Mehmet Ozansoy, Suna Lahut, Gönenç Çobanoğlu, A. Nazlı Başak 
 
Boğaziçi Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Nörodejenerasyon Araştırma Laboratuarı (NDAL), İstanbul 
 
Boğaziçi University, Molecular Biology and Genetics, Neurodegeneration Research Laboratory (NDAL), Istanbul, Turkey 
 
AMAÇ:  Alsin  geninin  kodladığı  Alsin  proteini,  bir  GTPaz  olan  Rab5’in  Guanin  Nükleotid  Değişim  Faktörü’dür. 
Alsin  proteininde,  Ras  Süper  Familyasından  bir  RCC1  benzeri  GTPaz  bölgesi,  bir  DH/PH  bölgesi  ve  bir  VPS9 
bölgesi  bulunmaktadır.  Alsin  geninde  görülen  mutasyonlar  Amiyotrofik  Lateral  Skleroz,  Primer  Lateral  Skleroz 
ve  İnfantil-başlangıçlı  Asending  Spastik  Paraliz’e  neden  olmaktadır.  Bu  mutasyonların,  proteinde  ne  gibi  bir 
fonksiyon  değişikliğine  ya  da  kaybına  neden  olduğu  bilinmemektedir.  Alsin  proteininin  fonksiyonu  tam  olarak 
bilinmemekle beraber, endozomal trafikte ve akzonal taşımada rol oynadığı düşünülmektedir. Çalışmanın amacı, 
Alsin  gen  ifadesinin  susturulmasının,  seçilen  bazı  genlerin  ifadesine  etkisini  araştırmak  ve  pozitif  adayların 
kodladıkları proteinlerle Alsin arasındaki etkileşimi incelemektir. 
GEREÇ  ve  YÖNTEM:  Çalışmada  nöronal  N2a  hücre  hattı,  Alsin  geninin  DH/PH  bölgesine  spesifik  shRNA  ile 
transfekte edilmiş ve antibiyotik seleksiyonuyla Alsin geninin susturulduğu stabil bir hücre hattı oluşturulmuştur. 
Alsin  geninin  ve  seçilmiş  diğer  genlerin  ifade  seviyeleri,  qRT-PZR  ile  ölçülmüş,  istatistiksel  olarak  anlamlı 
sonuçlar  veren  adaylar  seçilmiş  ve  kodladıkları  proteinlerin,  immünositokimya  yöntemi  ile  Alsin  ile 
etkileşimlerine bakılmıştır. 
BULGULAR: qRT-PZR ölçümlerinde, Alsin geninin %73 oranında susturulduğu gösterilmiştir. Bu hücre hattında, 
Dctn1, Kif3a, Kif3b, spartin ve spastin genlerinin ifadelerinin anlamlı bir şekilde değiştiği yine qRT-PZR ile tespit 
edilmiştir.  Bu  genlerin  kodladıkları  proteinlere  immünositokimya  ile  bakıldığında,  hücre  çekirdeğine  yakın  bir 
bölgede Alsinin,  spastin ve kif3a proteinleriyle kolokalize olduğu görülmüştür. 
SONUÇ:  Çalışma  çerçevesinde  Alsin  geni  susturulduğunda  akzonal  taşımada  görev  alan  bazı  genlerin  ifade 
seviyelerinin  değiştiği  bulunmuştur.  Bu  genlerin  kodladıkları  proteinlerle  Alsin  arasında    etkileşim  görülmemiş 
olması  Alsin  ifadesinin,  söz  konusu  genlerin  ifadelerini  dolaylı  yoldan  etkileyebileceğini  düşündürmektedir.  Öte 
yandan spastin ve Kif3a ile Alsin arasındaki korelasyonlar, gen ifade seviyelerinin yanısıra protein seviyelerinde 
de görülmüştür.  
 
Anahtar Kelimeler: Alsin, N2a, İmmünositokimya 
 
Possible interacting partners of Alsin and its effect of expression 
 
OBJECTIVES:  Alsin  is  a  ubiquitously  expressed  protein,  abundant  in  neurons.  It  functions  as  a  guanine 
nucleotide  exchange  factor  for  the  small  GTPase  RAB5,  and  has  three  guanine-nucleotide  exchange  factor 
domains (RCC1-like, DH/PH and VPS9) that activate members of the Ras Super family of GTPases. Although the 
function of the Alsin protein is not fully understood, it has been hypothesized to regulate endosomal trafficking 
and  axonal  transport.  Mutations  in  the  Alsin  gene  cause  different  motor  neuron  diseases,  like  Juvenile 
Amyotrophic  Lateral  Sclerosis,  Primary  Lateral  Sclerosis  and  Infantile-Onset  Ascending  Spastic  Paralysis.  This 
study investigated the effect of the knockdown of the Alsin gene on expression patterns of several genes. 
MATERIALS & METHODS: First, stable Alsin-knockdown N2a cells were generated. The cells have been stably 
transfected  using  shRNA  for  the  DH/PH  region  of  the  Alsin  transcript,  and  subjected  to  antibiotic  selection. 
Then, qRT-PCR was used to investigate the changes in expression levels of Alsin and the selected genes. Lastly, 
the protein localizations were determined with immunocytochemistry. 
RESULTS:  Alsin  expression  level  was  decreased  73%  in  knockdown  cells.  qRT-PCR  data  showed  significant 
changes in Dctn1, Kif3a, Kif3b, spartin and spastin levels. The interactions of the corresponding proteins with 
Alsin were further investigated by immunocytochemistry;  perinuclear colocalizations of alsin with spastin and 
kif3a were observed. 
CONCLUSION: A significant correlation between alsin expression and Dctn1, Kif3a, Kif3b, spartin and spastin 
genes was found. Our results showed only spastin and Kif3a may interact with alsin. This could be interpreted 
as, alsin expression may indirectly affect expression levels of other selected genes.  
 
Keywords: Alsin, N2a, Immunocytochemistry 

Poster Bildiriler / Poster Presentations 
122 
 
P29 
 
Exome sequencing reveals mutations in NOTCH3 in a typical Alzheimer’s disease 
patient 
 
Ebba Lohmann
1*
, Rita J. Guerreiro
2,3,4*
,N. Luu
4
, B. Dursun
5
, N. Gurulian
3
, Başar Bilgiç
1
, Hakan 
Gürvit
1
, Murat Emre
1
, Haşmet Hanağası
1
, John Hardy
3
, Andrew Singleton
4
 
 
1
Department of Neurology, Istanbul Medical School, Istanbul University, Istanbul, Turkey 
2
Center for Neuroscience and Cell Biology, University of Coimbra, Coimbra, Portugal 
3
Department of Molecular Neuroscience, Institute of Neurology, London, United Kingdom 
4
Laboratory of Neurogenetics, National Institute on Aging, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, United States of 
America 
5
Istanbul University, Institute for Experimental Medicine, Istanbul, Turkey 
*These authors contributed equally to this work