The Abdominal Sepsis Study: Epidemiology of Etiology and Outcome

diagnosis,  surgery  or  other  invasive  procedure  to  diagnose  IAI,  e.g.  fine  needle 

aspiration)

 

 

6.1.   Sepsis grading 

(tick and complete the severity of sepsis at day of diagnosis)

 

 

 Sepsis 

(≥2 systemic inflammatory response criteria)

: 

 fever 

(body temperature >38°C) or hypothermia (<36°C)

 

 

 

 tachycardia 

(heart rate >90/min.)

 

 

 

 tachypnea 

(respiratory rate >20/min or PaCO2 <32 mmHg) 

 

 

 leucocytosis 

(white blood cell count >12,000 cells/ L)

 or leucopenia 

(>4,000/ L)

 

 

 

 Severe sepsis – associated organ dysfunctions: 

 non-invasive mechanical ventilation 

 invasive mechanical ventilation with intubation or tracheotomy 

 acute kidney injury 

(serum creatinin ≥1.2 mg/dL or 111 µmol/L) 

 

 

 acute liver failure 

(serum bilirubin ≥1.2 mg/dL or 20 µmol/L)

 

 

 

 acute neurologic failure 

(Glasgow coma scale ≤14)

 

 

 

 coagulation disorder 

(platelet count <150,000 / L)

 

 

 Septic  shock  –  associated  hypotension 

(systolic  blood  pressure  <90  mmHg 

unresponsive to fluid administration) 

6.2. Organ failure assessment 

(SOFA-score)

 

•  Respiratory failure (PaO2/FiO2) 

 

 

 <400  

 

 

 <300  

 

 

 <200 (with respiratory support)  

 

 

 <100 (with respiratory support)  

•  Coagulation disorder (platelet count x 10

9

/L.) 

 

 

 <150  

 

 

 <100  

 

 

 <50  

 

 

 <20 

 

•  Liver failure (bilirubin, mg/dL) 

 

 

 1.2 – 1.9 (or 20 – 33 µmol/L) 

 

 

 2.0 – 5.9 (or 34 – 101 µmol/L)  

 

 

 6.0 – 11.9 (or 102 – 204 µmol/L)  

 

 

 ≥12.0 (or ≥204 µmol/L)  

•  Renal failure (creatinine, mg/dL or urine output) 

 

 

 1.2 – 1.9 (or 110 – 170 µmol/L) 

 

 

 2.0 – 3.4 (or 171 – 299 µmol/L)  

 

 

 3.5 – 4.9 (or 300 – 440 µmol/L) or <500 mL/day 

 

 

 ≥5.0 (or ≥440 µmol/L)  or <200mL/day

 

•  Hypotension 

 

 

 mean art. pressure <70 mmHg or systolic art. pressure <90 mmHg  

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

25/33 

 

 

 dopamine ≤5 mcg/kg/min or dobutamine (any dose)  

 

 

 dopamine >5 mcg/kg/min or (nor)adrenaline at ≤1 mcg/kg/min  

 

 

 dopamine >15 mcg/kg/min or (nor)adrenaline at >0.1 mcg/kg/min  

•  Glasgow coma scale (effective if not sedated, estimated if sedated) 

 13-14  

 

 

 10-12  

 

 

 6-9  

 

 

 <6  

6.3. Organ support 

 

  mechanical ventilation (invasive or non-invasive) 

 

  inotropic/vasopressor support 

 

  renal replacement therapy 

 

 

  for acute kidney injury 

 

 

  for removal of inflammatory cytokines/endotoxins

 

 

6.4. Miscellaneous 

Lactate  

 

(max.)  __ __ . __   mmol/L 

pH 

 

 

(min.) __ . __ __ 

(range 6.8 – 7.8)

 

c-reactive protein 

__ __ . __ __ mg/L 

(range 0.02 – 250)

 

procalcitonin   

__ __ . __ __ mcg/L 

(range 0.05 – 100)

 

white blood cell count  __ __ __ __ __ cells/mcL 

(range 300 – 40,000) 

 

Intra-abdominal pressure: __ __ __ mm Hg

 

 

 

Indicate method used to measure IAP 

 

 

 

 

  inferior vena cave 

  intra-gastric  

  transgastral 

 

 

  urinary bladder    

  transvesical technique (?) 

 

 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

26/33 

Section 7 – Severity of disease assessment: early post-diagnosis  

(worst  parameters  observed  within  a  24  hrs.  time  frame  after  medical  diagnosis, 

surgery or other invasive procedure to diagnose IAI, e.g. fine needle aspiration) 

 

7.1.   Sepsis grading 

(tick and complete the severity of sepsis 72 hrs after diagnosis)

 

 

 Sepsis 

(≥2 systemic inflammatory response criteria)

: 

 fever 

(body temperature >38°C) or hypothermia (<36°C)

 

 

 

 tachycardia 

(heart rate >90/min.)

 

 

 

 tachypnea 

(respiratory rate >20/min or PaCO2 <32 mmHg) 

 

 

 leucocytosis 

(white blood cell count >12,000 cells/mcL)

 or leucopenia 

(>4,000/mcL)

 

 

 

 Severe sepsis – associated organ dysfunctions: 

 non invasive mechanical ventilation 

 invasive mechanical ventilation with intubation or tracheotomy 

 acute kidney injury 

(serum creatinin ≥1.2 mg/dL or 111 µmol/L) 

 

 

 acute liver failure 

(serum bilirubin ≥1.2 mg/dL or 20 µmol/L)

 

 

 

 acute neurologic failure 

(Glasgow coma scale ≤14)

 

 

 

 coagulation disorder 

(platelet count <150,000 / L)

 

 

 Septic  shock  –  associated  hypotension 

(systolic  blood  pressure  <90  mmHg 

unresponsive to fluid administration) 

7.2. Organ failure assessment 

(SOFA-score)

 

•  Respiratory failure (PaO2/FiO2) 

 

 

 <400 

 

 

 <300 

 

 

 <200 (with respiratory support) 

 

 

 <100 (with respiratory support) 

•  Coagulation disorder (platelet count x 10

9

/L.) 

 

 

 <150 

 

 

 <100 

 

 

 <50 

 

 

 <20 

•  Liver failure (bilirubin, mg/dL) 

 

 

 1.2 – 1.9 (or 20 – 33 µmol/L) 

 

 

 2.0 – 5.9 (or 34 – 101 µmol/L) 

 

 

 6.0 – 11.9 (or 102 – 204 µmol/L) 

 

 

 ≥12.0 (or ≥204 µmol/L) 

•  Renal failure (creatinine, mg/dL or urine output) 

 

 

 1.2 – 1.9 (or 110 – 170 µmol/L) 

 

 

 2.0 – 3.4 (or 171 – 299 µmol/L)  

 

 

 3.5 – 4.9 (or 300 – 440 µmol/L) or <500 mL/day 

 

 

 ≥5.0 (or ≥440 µmol/L)  or <200mL/day

 

 

•  Hypotension 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

27/33 

 

 

 mean arterial pressure <70 mmHg or systolic arterial pressure <90 mmHg 

 

 

 dopamine ≤5 mcg/kg/min or dobutamine (any dose) 

 

 

 dopamine >5 mcg/kg/min or (nor)adrenaline at ≤1 mcg/kg/min 

 

 

 dopamine >15 mcg/kg/min or (nor)adrenaline at >0.1 mcg/kg/min 

 

•  Glasgow coma scale (effective if not sedated, estimated if sedated) 

 13-14 

 

 

 10-12 

 

 

 6-9 

 

 

 <6 

7.3. Organ support 

 

  mechanical ventilation (invasive or non-invasive) 

 

  inotropic/vasopressor support 

 

  renal replacement therapy 

 

 

  for acute kidney injury 

 

 

  for removal of inflammatory cytokines/endotoxins

 

7.4. Miscellaneous 

Lactate  

 

(max.)  __ __ . __   mmol/L 

pH 

 

 

__ . __ __ 

c-reactive protein 

__ __ . __ __ mg/L 

procalcitonin   

__ __ . __ __ mcg/L 

white blood cell count  __ __ __ __ __ cells/mL 

Intra-abdominal pressure: __ __ __ mm Hg

 

 

 

Indicate method used to measure IAP 

 

 

 

 

  inferior vena cave 

  intra-gastric  

  transgastral 

 

 

  urinary bladder    

  transvesical technique 

 

 

 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

28/33 

Section  8  –  Severity  of  disease  assessment:  72  hrs.  post-diagnosis 

(worst 

parameters  observed  72  hrs.  after  medical  diagnosis,  surgery  or  other  invasive 

procedure to diagnose IAI, e.g. fine needle aspiration) 

 

 

8.1.   Sepsis grading 

(tick and complete the severity of sepsis 72 hrs after diagnosis)

 

 

 Sepsis 

(≥2 systemic inflammatory response criteria)

: 

 fever 

(body temperature >38°C) or hypothermia (<36°C)

 

 

 

 tachycardia 

(heart rate >90/min.)

 

 

 

 tachypnea 

(respiratory rate >20/min or PaCO2 <32 mmHg) 

 

 

 leucocytosis 

(white blood cell count >12,000 cells/ L)

 or leucopenia 

(>4,000/ L)

 

 

 

 Severe sepsis – associated organ dysfunctions: 

 non-invasive mechanical ventilation 

 invasive mechanical ventilation with intubation or tracheotomy 

 acute kidney injury 

(serum creatinin ≥1.2 mg/dL or 111 µmol/L) 

 

 

 acute liver failure 

(serum bilirubin ≥1.2 mg/dL or 20 µmol/L)

 

 

 

 acute neurologic failure 

(Glasgow coma scale ≤14)

 

 

 

 coagulation disorder 

(platelet count <150,000 / L)

 

 

 Septic  shock  –  associated  hypotension 

(systolic  blood  pressure  <90  mmHg 

unresponsive to fluid administration) 

8.2. Organ failure assessment 

(SOFA-score)

 

•  Respiratory failure (PaO2/FiO2) 

 

 

 <400 

 

 

 <300 

 

 

 <200 (with respiratory support) 

 

 

 <100 (with respiratory support) 

•  Coagulation disorder (platelet count x 10

9

/L.) 

 

 

 <150 

 

 

 <100 

 

 

 <50 

 

 

 <20 

•  Liver failure (bilirubin, mg/dL) 

 

 

 1.2 – 1.9 (or 20 – 33 µmol/L) 

 

 

 2.0 – 5.9 (or 34 – 101 µmol/L) 

 

 

 6.0 – 11.9 (or 102 – 204 µmol/L) 

 

 

 ≥12.0 (or ≥204 µmol/L) 

•  Renal failure (creatinine, mg/dL or urine output) 

 

 

 1.2 – 1.9 (or 110 – 170 µmol/L) 

 

 

 2.0 – 3.4 (or 171 – 299 µmol/L)  

 

 

 3.5 – 4.9 (or 300 – 440 µmol/L) or <500 mL/day 

 

 

 ≥5.0 (or ≥440 µmol/L)  or <200mL/day

 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

29/33 

 

•  Hypotension 

 

 

 mean arterial pressure <70 mmHg or systolic arterial pressure <90 mmHg 

 

 

 dopamine ≤5 mcg/kg/min or dobutamine (any dose) 

 

 

 dopamine >5 mcg/kg/min or (nor)adrenaline at ≤1 mcg/kg/min 

 

 

 dopamine >15 mcg/kg/min or (nor)adrenaline at >0.1 mcg/kg/min 

 

•  Glasgow coma scale (effective if not sedated, estimated if sedated) 

 13-14 

 

 

 10-12 

 

 

 6-9 

 

 

 <6 

 

8.3. Organ support 

 

  mechanical ventilation (invasive or non-invasive) 

 

  inotropic/vasopressor support 

 

  renal replacement therapy 

 

 

  for acute kidney injury 

 

 

  for removal of inflammatory cytokines/endotoxins 

 

8.4. Miscellaneous 

Lactate  

 

(max.)  __ __ . __   mmol/L 

pH 

 

 

__ . __ __ 

c-reactive protein 

__ __ . __ __ mg/L 

procalcitonin   

__ __ . __ __ mcg/L 

white blood cell count  __ __ __ __ __ cells/mL 

Intra-abdominal  pressure 

(if  the  patient  was  operated  for  abdominal  source  control,  report  the 

post-surgical procedure value) 

__ __ __ mm Hg

 

 

 

Indicate method used to measure IAP 

 

 

 

 

  inferior vena cave 

  intra-gastric  

  transgastral 

 

 

  urinary bladder    

  transvesical technique 

 

 

 

 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

30/33 

Section 9 – Source control assessment: 7 days after intervention  

(day of surgical intervention = day zero) 

 

 

 not applicable (no source control performed/required) 

 

Is adequate source control achieved?  

 Yes, no signs of perforation or persistent inflammation are present 

 No, signs of persistent inflammation are present but no surgical revision 

has been executed 

 No, the patient required additional surgical intervention because of: 

 

 

  anastomotic leakages, perforation 

 

 

  intestinal obstruction 

   abdominal  compartment  syndrome  (decompressive 

laparotomy) 

 

 

  haemorrhage  

 

 

  other  

 

 

 

Date of 1

st

 surgical revision: 

(day/month/year)

:  

__ ___ ____ 

 

Number of surgical interventions during the first week:  

__ __ 

 

 

 

 

 

 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

31/33 

Section 10 – Outcome (28-day follow up) 

 

 Additional  surgical  intervention  for  abdominal  sepsis 

(later  than  those  mentioned 

within the first 7 days following initial source control procedure; section 9) 

 

Number of surgical interventions during the first week:  

__ __ 

 

Stop antimicrobial therapy (for abdominal sepsis): 

(day/month/year)

:  

__ ___ ____

 

 

 not applicable (ongoing) 

 

 

ICU discharge: 

(day/month/year)

:  

__ ___ ____

 

 

 

 not applicable (ongoing) 

 

Organ support during ICU stay 

 

 

  mechanical ventilation (invasive or non-invasive) 

 

 

  inotropic/vasopressor support 

 

 

  renal replacement therapy 

 

 

 

  for acute kidney injury 

 

 

 

  for removal of inflammatory cytokines/endotoxins

 

 

Survival status  

 

 

  alive 

 

 

  death 

 

 

 

Death related to abdominal sepsis 

(clinical judgement)

 

 

 

 

 

  yes 

 

 

 

 

  uncertain 

 

 

 

 

  no 

(other complication likely to cause death) 

 

 

 

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

32/33 

Appendix 3 - Codes list admission diagnosis (2.5.) 

 

PRIMARY and SECONDARY DIAGNOSES 

Description:  The  primary  and  maximally  3  secondary  diagnoses  (acute  or  acute  on  chronic  disease)  should  be 

recorded for all patients as they best reflect the reason(s) for ICU admission. 

 

100 Neurological:  

101  Stroke by ischemic or haemorrhagic mechanism (non-traumatic)  

102  Intracerebral hemorrhage 

103  Subarachnoid hemorrhage 

104  Neurologic infection 

105  Neurologic neoplasm 

106  Neuromuscular disease  

107   Dementia 

108   Seizures 

109   Polyneuritis  and  polyradiculoneuritis:  includes  polyneuritis  due  to  infection,  inflammation,  toxic, 

Guillain-Barré syndrome  

110   Post-anoxic coma 

111   Delirium tremens 

112   Spinal cord surgery 

113  Other 

 

 

200 Respiratory:  

201  Exacerbation of chronic pulmonary disease (either obstructive or non obstructive) 

202  Asthma attack 

203  Pulmonary embolism 

204  Pleural effusion 

205  Mechanical airway obstruction 

206  Inhalation pneumonitis: induced by gastrointestinal contents, blood, smoke, and/or gases 

207  Respiratory neoplasm (include larynx and trachea) 

208  Respiratory arrest 

209  Pulmonary edema (non-cardiogenic) 

210  Community-acquired bacterial pneumonia 

211  Healthcare-associated bacterial pneumonia  

212  Viral pneumonia 

213  Fungal pulmonary infection 

214  Near-drowning 

215  Other 

 

300 Cardiovascular / vascular:  

301  Acute myocardial infarction 

302  Unstable angina 

303  Cardiac arrest 

304  Cardiopathy: includes ischemic, valvular, hypertensive, alcoholic and other, non-infectious forms 

305  Cardiogenic shock 

306  Congestive heart failure 

307  Rhythm disturbance 

308  Perivascular disease 

309  Hypertension 

310  Aortic aneurysm 

311  Dissecting/ruptured aorta 

312  Elective abdominal aneurysm repair 

313  Peripheral vascular surgery 

314  Valvular heart surgery 

315  CABG 

316  Peripheral artery bypass graft 

317  Carotid endarterectomy 

318  Endocarditis 

319  Other  

Study Protocol & CRF 

AbSeS version#1.0_2015.12.31 

33/33 

400 Renal/genito-urinary tract:  

401  Acute kidney injury  

402  Chronic renal failure  

403  Renal neoplasia  

404  Non-malignant  gynaecological  diseases,  non-malignant:  lesions  of  ovary,  uterus,  cervix,  vulvae, 

vagina not due to neoplasia  

405  Malignant gynaecological diseases 

406  Urosepsis 

407  Other  

 

500 Hematological:  

501  Transfusion reaction 

502  Neutropenia 

503  Neutropenic sepsis 

504  Thrombocytopenia, coagulopathy 

505  Non-malignant disease (e.g. anaemia, aplastic anaemia, methemoglobinemia, congenital disorders of 

blood coagulation factors)  

506  Malignant disease: lymphoma, acute leukaemia and multiple myeloma 

507  Other  

 

600 Digestive:  

601  Hepatic failure 

602  Gastro-intestinal perforation/obstruction/rupture 

603  Gastro-intestinal bleeding due to varices, ulcer or diverticulitis 

604  Inflammatory disease (ulcerative colitis, crohn’s disease) 

605  Neoplasia of the upper digestive tract (oesophageal, gastric or duodenal) 

606  Neoplasia of the lower digestive tract (colon and rectum) 

607  Pancreatitis 

608  Other  

 

700 Metabolic:  

701  Drug overdose, intoxication 

702  Diabetic ketoacidosis  

703  Metabolic coma 

704  Endocrinopathy 

705  Other  

 

800 Pregnancy-related:  

801  Eclampsia, preeclampsia 

802  HELLP syndrome 

803  Delivery haemorrhage 

804  Other  

 

900 Trauma & skin:  

901  Head trauma (isolated) 

902  Polytrauma, without brain trauma 

903  Polytrauma, with brain trauma  

904  Spinal cord injury 

905  Burn injury 

906  Skin lesions requiring intensive care, non-traumatic (e.g. toxic epidermal necrolysis) 

907  Pressure ulcer requiring surgical debridement or extensive wound care 

908  Severe surgical wound infection 

909  Other  

 

000 Other diseases